Conocida en época medieval como iglesia de San Miguel de la Villanueva, la actual parroquia de San Miguel es al menos la tercera versión del templo situado en este punto del centro histórico murciano. Del primero de ellos existen datos desde la segunda mitad del siglo XIII y fue derribado a comienzos del siglo XVII debido a su deplorable estado. Cuando su sustituto estaba prácticamente concluido, la denominada riada de San Calixto lo derrumbó por completo. Unas décadas más tarde comenzaron las obras de la iglesia actual, que fue consagrada a comienzos del siglo XVII. Un percance adicional ocurrió a mediados del siglo XIX, cuando se derrumbó la torre a causa de unas filtraciones procedentes de una acequia vecina, por lo que hubo que reponerla. El resultado final es uno de los ejemplos más característicos del barroco murciano, en el que destaca especialmente el magnífico retablo mayor, obra de Jacinto Perales y Francisco Salzillo. Diversas obras escultóricas de este último se conservan también en diferentes puntos del interior, algunas de las cuales procesionan durante la Semana Santa murciana.